Sean King bliver kontaktet af et hemmelighedsfuldt selskab, der vil have ham til at undersøge de mystiske omstændigheder omkring en af deres topmatematikeres død. Snart bliver han blandet ind i en verden af elitefysikere og -matematikere, CIA- og FBI-agenter, spioner, krigshelte og meget mere. Da han pludselig selv befinder sig i skudlinjen får han brug fra hjælp – både fra en tilsyneladende restitueret Michelle, og fra en ung, autistisk pige, der er genial med tal og har at helt særligt talent for at bryde koder.

Geniets hemmelighed er bind tre i King & Maxwell-serien.